微生物制造技术在降低环境污染、促进可再生资源替代化石资源方面有着良好的发展前景。而我国微生物制造产业水平与国际差距明显，主要原因在于工业菌种水平低下，某些重要的氨基酸、化工醇等产品长期依赖进口。发展微生物的基因组规模系统代谢育种技术改造工业菌种，是加速我国工业菌种性能提升的重要前提。

由安徽华恒生物工程有限公司联合三家大学和科研机构的“十二五”863计划生物和医药技术领域“基因组规模系统代谢育种”项目开展了基因组规模系统代谢育种关键技术及产品开发，并取得重要进展。构建了葡萄糖高效转化为L-丙氨酸的大肠杆菌细胞工厂，建立起1万吨/年规模化生产示范线，生产成本降低40%以上，新增总产值2.09亿元。该项目获首届“中国创新创业大赛”全国三等奖、2014年产学研合作创新成果奖和2014年石油和化学工业联合会科技进步二等奖。